This is a preview deployment banner

PPD_0059V2C.1

Belgium/PPD_0059V2C.1/2025-12-20
T. de Block, D. Jansen, K. Ramadan, J. Coppens, M. Van Esbroeck & K. Vercauteren

Institute of Tropical Medicine, Antwerpen

Sample details

Collection date
2025-12-20
Sampling location
Belgium
Isolate name
ITM_25123105

Data use terms

Data use terms
OPEN

Data use terms history

ChangedUserData use terms
2026-04-11 16:49insdc_ingest_userOPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
F.2

INSDC

INSDC accession
BioProject accession
BioSample accession
NCBI release date
2026-02-14
NCBI update date
2026-02-15

Host

Host

Submission details

Submission ID
OZ412553.1
Submitting group
Date submitted
2026-04-11 16:23:26 UTC
Date released
2026-04-11 20:15:26 UTC
Earliest release date
2026-02-14

Alignment and QC

Length
190788 (96.3%)
# of SNPs
96
# of unknown bases
825

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

  • C882T
  • G1262A
  • G2591A
  • G3111A
  • C3257T
  • G3522A
  • C3818T
  • C7771T
  • G12690A
  • G14000T
  • G15428A
  • A18769G
  • C20453T
  • G21723A
  • C22167T
  • C23564T
  • G25661A
  • C27826T
Deletions
N/A
Insertions
N/A

Amino acid substitutions

Substitutions called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:S105L
  • OPG001:D232N

OPG002

  • OPG002:S54F

OPG003

  • OPG003:D264N
  • OPG003:E451K

OPG023

  • OPG023:P71S

OPG025

  • OPG025:A423D

OPG043

  • OPG043:E44K

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG071

  • OPG071:L108F

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG089

  • OPG089:E109K

OPG092

  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:M142I

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG105

  • OPG105:S734L
  • OPG105:R1263K

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG118

  • OPG118:K606E

OPG120

  • OPG120:D151N

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG150

  • OPG150:S307L

OPG174

  • OPG174:D288N

OPG176

  • OPG176:H221Y

OPG188

  • OPG188:E12K

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG210

  • OPG210:D209N
  • OPG210:P722S
  • OPG210:M1741I
Deletions
N/A
Insertions
N/A

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue