This is a preview deployment banner

PPD_005MMX4.1

Belgium/PPD_005MMX4.1/2026-05-04
T. de Block, D. Jansen, K. Ramadan, J. Coppens, M. Van Esbroeck & K. Vercauteren

Institute of Tropical Medicine, Antwerpen

Sample details

Collection date
2026-05-04
Sampling location
Belgium
Isolate name
26043749

Data use terms

Data use terms
OPEN
Data use terms URL

Clade & Lineage

Clade
IIb
Outbreak
sh2017
Lineage
F.2

INSDC

INSDC accession
BioProject accession
BioSample accession
NCBI release date
2026-07-11
NCBI update date
2026-07-12

Submission details

Submission ID
OZ493609.1
Submitting group
Date submitted
2026-07-16 11:49:11 UTC
Date released
2026-07-16 14:45:05 UTC
Earliest release date
2026-07-11

Alignment and QC

Length
197195 (100%)
# of SNPs
100
# of inserted bases
91
# of deleted bases
105
# of unknown bases
41

Nucleotide mutations

Mutations called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions
  • G1262A
  • G2591A
  • G3111A
  • G3522A
  • C3818T
  • C7771T
  • G12690A
  • G14000T
  • G15428A
  • A18769G
  • C20453T
  • G21723A
  • C22167T
  • C23564T
  • G25213A
  • G25661A
  • C27826T
  • T28175C
Deletions
607-609, 133177-133186, 150586-150602, 179172-179243, 196615-196617
Insertions
ins_0:TAATTAATTTA, ins_133102:TT, ins_173315:NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN, ins_197209:TAAATTAATTA

Amino acid substitutions

Substitutions called relative to the NC_063383.1 reference

Substitutions

OPG001

  • OPG001:S105L

OPG002

  • OPG002:S54F

OPG003

  • OPG003:D264N

OPG023

  • OPG023:P71S

OPG025

  • OPG025:A423D

OPG040

  • OPG040:S89F

OPG043

  • OPG043:E44K

OPG047

  • OPG047:R48C

OPG053

  • OPG053:P78S

OPG056

  • OPG056:E125K

OPG057

  • OPG057:E353K

OPG063

  • OPG063:S54L

OPG071

  • OPG071:L108F
  • OPG071:E856K

OPG072

  • OPG072:D56N

OPG092

  • OPG092:D196N

OPG093

  • OPG093:S30L
  • OPG093:D88N

OPG094

  • OPG094:M142I

OPG098

  • OPG098:E162K

OPG105

  • OPG105:S734L

OPG109

  • OPG109:H740Y

OPG118

  • OPG118:K606E

OPG120

  • OPG120:D151N

OPG136

  • OPG136:D98N

OPG139

  • OPG139:A17T

OPG143

  • OPG143:D68N

OPG145

  • OPG145:E62K
  • OPG145:R243Q
  • OPG145:E435K

OPG150

  • OPG150:S307L

OPG161

  • OPG161:E5K

OPG176

  • OPG176:S106F
  • OPG176:H221Y

OPG180

  • OPG180:E291K

OPG188

  • OPG188:E12K

OPG193

  • OPG193:L263F

OPG210

  • OPG210:D209N
  • OPG210:P722S
  • OPG210:M1741I
Deletions
N/A
Insertions
N/A

Report an issue with this sequence or metadata

Create GitHub issue